Distribución alélica de 15 loci STRs autosómicos en la zona nororiental de Perú
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Date
2019
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Publisher
Universidad Nacional de Trujillo
Abstract
La variabilidad genética en el ADN repetitivo es una herramienta forense para el estudio de poblaciones humanas, incluyendo la identificación de individuos o las relaciones de parentesco entre éstos. El presente estudio tuvo como objetivo caracterizar la distribución alélica en 15 loci STR autosómicos en poblaciones humanas provenientes de la zona nororiental de Perú: Tumbes, Piura, Lambayeque, La Libertad, Cajamarca y Amazonas. El análisis de la diversidad genética de todos los loci STR analizados (D8S1179, D21S11, D7S820, CSF1PO, D3S1358, TH01, D13S317, D16S539, D22S1338, D19S433, vWA, TPOX, D18S51, D5S818 y FGA) nos permitió obtener un total de 147 alelos en total, y un promedio acumulado de 9.8 alelos, siendo el alelo 11 del locus D5S818 el más frecuente del total de loci analizados. El locus FGA fue el más informativo con un poder de discriminación (PD) de 0.9655, poder de exclusión (PE) de 0.7320, la heterocigosidad observada (HO) de 0.8860 y el contenido de información polimórfica (PIC) de 0.8510, siendo estos valores, los más altos que se obtuvieron en el presente estudio. La totalidad de loci estaban en equilibrio de Hardy Weinberg (p>0.05). La probabilidad de Identidad (PI) para dos individuos no relacionados, varió entre 0.8170 para el locus D3S1358 y 0.9680 para el locus FGA, con un valor acumulado cercano a la unidad (>0.999999999). Los valores de FST y RST indican la ausencia de diferenciación genética (FST= 0.0049; RST= 0.0045; p>0.05) entre las 6 poblaciones de la zona nororiental del Perú. El análisis de estructura poblacional indica la ausencia de estructuración poblacional en la zona nororiental del Perú (K=1). El presente estudio busca contribuir con información referente a frecuencias y distribución de alelos en marcadores STRs de 6 regiones geográficas del Perú.
Description
Genetic variability in repetitive DNA is a forensic tool for the study of human populations; include the identification of individuals or kinship relationships between them. This study aimed to characterize the allelic distribution in 15 autosomal STR loci in the northeastern region from Peru: Tumbes, Piura, Lambayeque, La Libertad, Cajamarca and Amazonas. The analysis of the genetic diversity of all the STR loci analyzed (D8S1179, D21S11, D7S820, CSF1PO, D3S1358, TH01, D13S317, D16S539, D22S1338, D19S433, vWA, TPOX, D18S51, D5S818 and FGA ) allowed us to obtain a total of 147 alleles in total, and a cumulative average of 9.8, allele 11 of locus D5S818 being the most common of all analyzed. The FGA locus was the one that exhibited the highest informative data in PD, PE, HO and PIC, obtaining a discrimination power (PD) of 0.9655, exclusion power (PE) of 0.7320, the observed heterozygosity (HO) of 0.8860 and the Polymorphic information content (PIC) was 0.8510, these values being the highest obtained in the present study. All loci showed Hardy-Weinberg equilibrium (p>0.05). The probability of Identity (PI) for two unrelated individuals varied between 0.8170 for the D3S1358 locus and 0.9680 for the FGA locus, with a cumulative value close to 1 (>0.999999999). The values of the FST and RST indicate absent of genetic differentiation (FST= 0.0049; RST= 0.0045; p>0.05) of six populations from northeastern region from Peru. The population structure analysis indicate the absent of population structure in the northeastern region from Peru (K=1). The present study search to contribute with information about to allelic frequency and distribution in STR markers from 6 geographic regions from Peru.
Keywords
frecuencia alélica, diferenciación genética, STR