Browsing by Author "Perez Palomino, Luis Miguel"

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    Análisis metagenómico de la comunidad bacteriana del glaciar Pastoruri (Parque Nacional Huascarán, Perú), asociada a un entorno extremófilo
    (Universidad Nacional de Trujillo, 2020) Perez Palomino, Luis Miguel; Zavala de la Cruz, Fátima
    La deglaciación del Nevado Pastoruri está dejando expuestos grupos litológicos ricos en sulfuro que contaminan las aguas con metales pesados y disminuyen el pH, produciendo un drenaje ácido de roca (DAR), donde algunas bacterias extremófilas habitan y actúan como elemento catalizador acelerando los procesos de oxidación y acidificación. Por lo tanto, el objetivo de este trabajo fue determinar la composición metagenómica de la comunidad bacteriana del glaciar Pastoruri, asociada a un entorno extremófilo. Para ello, se determinaron seis puntos de muestreo correspondientes a pequeñas fuentes de agua comprendidos entre el Parque Nacional Huascarán y el nevado Pastoruri, en los cuales se midió in situ los parámetros físico químicos del agua; posteriormente, se recolectaron las muestras de agua y sedimento, se realizó la extracción del ADN metagenómico, se realizó la amplificación y el secuenciamiento de la región V4 del gen 16S ARNr mediante la técnica IonTorrent PGM; luego, las secuencias se procesaron informáticamente para la determinación de las unidades taxonómicas operativas (OTUs); finalmente, para el análisis estadístico y la graficación de resultados se utilizó el software libre RStudio. Se obtuvieron 515787 reads agrupados en 2682 OTUs bacterianos y distribuidos en 11 Phyla (>1%) hallándose dos Phyla comunes para todos los sitios de muestreo correspondiendo a las Proteobacterias (68.54%), como las más abundantes, y las Acidobacterias (20.95%). Asimismo, los géneros bacterianos que mostraron abundancias relativas predominantes fueron Acidiphilium (39.08%), Nitrosovibrio (19.43%), Acidithrix (24.94%), Cyanobacterium (11.97%), Geobacter (14.27%), Rhodoferax (13.71%), Granulicella (10.90%) y Ferrovum (13.22%).
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    Análisis metagenómico de la comunidad bacteriana del glaciar Pastoruri (Parque Nacional Huascarán, Perú), asociada a un entorno extremófilo
    (Universidad Nacional de Trujillo, 2020) Perez Palomino, Luis Miguel; Zavala de la Cruz, Fátima
    La deglaciación del Nevado Pastoruri está dejando expuestos grupos litológicos ricos en sulfuro que contaminan las aguas con metales pesados y disminuyen el pH, produciendo un drenaje ácido de roca (DAR), donde algunas bacterias extremófilas habitan y actúan como elemento catalizador acelerando los procesos de oxidación y acidificación. Por lo tanto, el objetivo de este trabajo fue determinar la composición metagenómica de la comunidad bacteriana del glaciar Pastoruri, asociada a un entorno extremófilo. Para ello, se determinaron seis puntos de muestreo correspondientes a pequeñas fuentes de agua comprendidos entre el Parque Nacional Huascarán y el nevado Pastoruri, en los cuales se midió in situ los parámetros físico químicos del agua; posteriormente, se recolectaron las muestras de agua y sedimento, se realizó la extracción del ADN metagenómico, se realizó la amplificación y el secuenciamiento de la región V4 del gen 16S ARNr mediante la técnica IonTorrent PGM; luego, las secuencias se procesaron informáticamente para la determinación de las unidades taxonómicas operativas (OTUs); finalmente, para el análisis estadístico y la graficación de resultados se utilizó el software libre RStudio. Se obtuvieron 515787 reads agrupados en 2682 OTUs bacterianos y distribuidos en 11 Phyla (>1%) hallándose dos Phyla comunes para todos los sitios de muestreo correspondiendo a las Proteobacterias (68.54%), como las más abundantes, y las Acidobacterias (20.95%). Asimismo, los géneros bacterianos que mostraron abundancias relativas predominantes fueron Acidiphilium (39.08%), Nitrosovibrio (19.43%), Acidithrix (24.94%), Cyanobacterium (11.97%), Geobacter (14.27%), Rhodoferax (13.71%), Granulicella (10.90%) y Ferrovum (13.22%).