Análisis in silico de compuestos de origen natural con actividad antagónica sobre el receptor 1 del neuropéptido S, en endometriosis

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dc.contributor.advisorVillarreal La Torre, Víctor Eduardo
dc.contributor.authorCordova Muñoz, Angella Milagritos
dc.date.accessioned2024-10-02T18:47:34Z
dc.date.available2024-10-02T18:47:34Z
dc.date.issued2024
dc.description.abstractLa endometriosis es una enfermedad que afecta a millones de mujeres e implica un cuadro clínico complejo, caracterizado por su relación con los mecanismos del dolor e inflamación. En la actualidad, el receptor 1 del neuropéptido S (NPSR1), es un nuevo objetivo terapéutico, pues la inhibición de la interacción con su ligando endógeno (neuropéptido S), desactiva sus vías metabólicas intracelulares, y la exacerbación de los síntomas antes descritos. Considerando a los productos naturales como una vasta fuente de moléculas bioactivas, la investigación analizó in silico a compuestos naturales con la finalidad de identificar aquellos con actividad antagónica sobre el receptor NPSR1. Para ello, se exportó moléculas de las bases de datos NPAtlas y NP_MRD, que presenten un fragmento molecular de SHA-68R; se calculó su actividad antagonista (pKB) mediante el análisis 2D-QSAR de sus descriptores moleculares, y seleccionó las más prometedoras para su análisis farmacodinámico sobre el receptor en estado activo e inactivo utilizando la aplicación AutoDockTools y Discovery Studio para la visualización 2D. Posterior al análisis, se seleccionó a la molécula 15, debido a su energía de afinidad de -8,7 kcal/mol, respaldada por sus múltiples enlaces de hidrógeno, y a la visualización 2D del mapa de sus interacciones. Los perfiles fisicoquímicos y farmacocinéticos de las moléculas seleccionadas determinaron que excedieron los límites permisibles, siendo común en moléculas naturales; no obstante, pueden servir como scaffolds y potenciarse, con la finalidad de contrarrestar esta enfermedad, para mejorar la calidad de vida de quienes la padecen.
dc.description.abstractABSTRACT Endometriosis is a disease that affects millions of women and involves a complex clinical picture, characterized by its relationship with the mechanisms of pain and inflammation. Currently, neuropeptide S receptor 1 (NPSR1) is a new therapeutic target, since the inhibition of the interaction with its endogenous ligand (neuropeptide S), deactivates its intracellular metabolic pathways, and the exacerbation of the symptoms described above. Considering natural products as a vast source of bioactive molecules, the research analysed natural compounds in silico to identify those with antagonistic activity on NPSR1. To do this, molecules were exported from the NPAtlas and NP_MRD databases, which present a molecular fragment of SHA-68R; their antagonist activity (pKB) was calculated by 2D-QSAR analysis of their molecular descriptors, and the most promising ones were selected for pharmacodynamic analysis on the receptor in active and inactive state using the AutoDockTools application and Discovery Studio for 2D visualization. After the analysis, molecule 15 was selected, due to its affinity energy of -8,7 kcal/mol, supported by its multiple hydrogen bonds, and the 2D visualization of the map of its interactions. The physicochemical and pharmacokinetic profiles of the selected molecules determined that they exceeded the permissible limits, being common in natural molecules; however, they can serve as scaffolds and be enhanced, to counteract this disease, to improve the quality of life of those who suffer from it.
dc.formatapplication/pdf
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.14414/22465
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Nacional de Trujillo
dc.publisher.countryPE
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
dc.sourceUniversidad Nacional de Trujillo
dc.sourceRepositorio Institucional UNITRU
dc.subjectEndometriosis. Receptor 1 del neuropéptido S. SHA-68R. Moléculas bioactivas. Modelado molecular
dc.subject.ocdehttps://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.01.05
dc.titleAnálisis in silico de compuestos de origen natural con actividad antagónica sobre el receptor 1 del neuropéptido S, en endometriosis
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesis
dc.type.versioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersion
renati.advisor.dni70323118
renati.advisor.orcidhttps://orcid.org/0000-0003-3956-3559
renati.author.dni70575275
renati.discipline917046
renati.jurorGamarra Sánchez, César Demófilo
renati.jurorRodríguez Silva, Cristhian Neil
renati.jurorYbañez Julca, Roberto Osmundo
renati.levelhttp://purl.org/pe-repo/renati/level#tituloProfesional
renati.typehttp://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis
thesis.degree.disciplineFarmacia
thesis.degree.grantorUniversidad Nacional de Trujillo. Facultad de Farmacia y Bioquímica
thesis.degree.nameQuímico Farmacéutico
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