Determinación de bacterias presentes en la rizósfera de Opuntia ficus-indica var. inermis en suelos áridos de Tumbes, Perú.
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Date
2016
Authors
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Publisher
UNIVERSIDAD NACIONAL DE TRUJILLO
Abstract
Las investigaciones sobre la microbiota existe en la rizósfera de las plantas y sus propiedades benéficas en el desarrollo y promoción del crecimiento de las mismas, han sido actualmente temas preferidos por investigadores, por lo que el objetivo de la presente investigación se orienta a determinar las bacterias presentes en la rizósfera de Opuntia ficus - indica en suelos áridos de Tumbes, Perú. El material biológico procedió de la rizósfera de Opuntia ficus - indica. El cultivo de las cepas aisladas se procesó en Tripticase Soy Broth y Luria Bertani, a las cuales se le hizo extracción de ADN, luego se aplicó la técnica de la PCR; con lo que se obtuvieron los amplicones de las muestras tratadas; por último se realizó la electroforesis y la respectiva secuenciación por el gen 16S ADNr, y por el método de metagenómica se identificó las bacterias cultivables y no cultivables presentes en la rizósfera; el análisis de los datos se hizo mediante el programa MG – RAST, se consultó con BLAST del NCBI para la identificación de la especie, se concluye que se logró identificar 46 especies de bacterias cultivables presentes en la rizósfera de Opuntia ficus – indica, mediante metagenómica se logró la identificación de las bacterias nativas cultivables y no cultivables presentes en la rizósfera, encontrándose cerca de 600 géneros por punto de muestreo.
Palabras clave: rizósfera, Opuntia ficus - indica, metagenómica.
Description
Research on the microbiota exists in the rhizosphere of plants and their beneficial effects on the development and promotion of growth thereof, have now been favorite subjects for researchers, so that the objective of this research is aimed at determining bacteria present in the rhizosphere of Opuntia ficus-indica in arid soils of Tumbes, Peru. The biological material came from the rhizosphere of Opuntia ficus - indica. The cultivation of isolates processed in Trypticase Soy Broth and Luria Bertani, to which was made DNA extraction, then the PCR technique was applied; whereby the amplicons of the treated samples were obtained; Finally respective electrophoresis and sequencing the 16S rDNA was performed, and the method of metagenomics cultivable and non-cultivable bacteria was identified in the rhizosphere; The data analysis was done using the program MG- RAST were consulted BLAST of NCBI to identify the species, it is concluded that was possible to identify 46 species of cultivable bacteria in the rhizosphere of Opuntia ficus - indica, using metagenomics identification of arable and non-arable these native bacteria in the rhizosphere, being about 600 genera per sampling point was achieved. Keywords: rhizosphere, Opuntia ficus-indica, metagenomics.
Keywords
Rizósfera, Opuntia ficus - indica, metagenómica.