Caracterización y variación molecular en Diatraea saccharalis en Saccharum officinarum de las regiones La Libertad y Lima, Perú – 2018

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dc.contributor.advisorCarbajal Villaverde, Aida esther
dc.contributor.authorLeón Alcántara, Eduardo Enrique
dc.date.accessioned2019-10-03T17:39:25Z
dc.date.available2019-10-03T17:39:25Z
dc.date.issued2019
dc.descriptionABSTRACT The objective of the present investigation was the characterization and molecular variation in Diatraea saccharalis Fabricius from the cultivation of Saccharum officinarum L. "Caña de azúcar" from La Libertad and Lima regions using RAPDS for its easy application and low cost. For this, the OPA-08, OPA-11, OPC-11, OPP-17 and GyakuU-13 markers were used. First, total DNA extraction was done with the help of commercial Kit, which was then PCR-tested with the following conditions: denaturation of the initial DNA was 94ºC for 3 minutes. This step was followed by 30 cycles of amplification (94 ° C: 1 min, 35 ° C: 1 min, 72 ° C: 1:30 min.). After the cycles, a final extension of 3 minutes was made at 72 ºC. PCR results were observed in 4% polyacrylamide gels. It was observed that OPA8 generated 18 bands, OPA11 23 bands, OPP17 12 bands, the OPC11 marker 19 bands and Gyaku13 23 bands. With this, matrices of presence and absence were filled and then entered into the Popgene32 program to perform the different statistical analyzes, showing that the populations have low intrepoblational and high intrapopulation genetic differentiation. Similarly, in the dendograms a grouping between the populations is observed of Casa Grande and Barranca, likewise, different groups and individuals are observed within each population.es_PE
dc.description.abstractRESUMEN La presente investigación tuvo como objetivo la caracterización y variación molecular de las tres poblaciones de Diatraea saccharalis Fabricius proveniente del cultivo de Saccharum officinarum L. “caña de azúcar” de las regiones La Libertad y Lima haciendo uso de RAPDS. Para esto se utilizaron los marcadores OPA-08, OPA-11, OPC-11, OPP-17 y GyakuU-13. Primero se hizo extracción de ADN total con ayuda de Kit comercial a los cuales luego se realizó PCR con las siguientes condiciones: desnaturalización del ADN inicial fue de 94ºC por 3 minutos. Este paso fue seguido por 30 ciclos de amplificación (94ºC: 1 min, 35ºC: 1 min, 72ºC: 1:30 min.). Después de los ciclos, se realizó una extensión final de 3 minutos a 72 ºC. Los resultados de PCR fueron observados en geles de poliacrilamida al 4%. Se observó que OPA8 generó 18 bandas, OPA11 23 bandas, OPP17 12 bandas, el marcador OPC11 19 bandas y Gyaku13 23 bandas. Con esto se llenaron matrices de presencia y ausencia que luego fueron ingresadas en el programa Popgene32 para realizar los diferentes análisis estadísticos, obteniéndose que las poblaciones no se diferencian genéticamente entre ellas pero si dentro de ellas, del mismo modo se observó en los dendogramas un agrupamiento entre las poblaciones de Casa Grande y Barranca. Se llega a la conclusión que dentro de cada población existen sub grupos e individuos diferenciados genéticamente.es_PE
dc.description.uriTesises_PE
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.14414/14271
dc.language.isospaes_PE
dc.publisherUniversidad Nacional de Trujilloes_PE
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccesses_PE
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/pe/es_PE
dc.sourceUniversidad Nacional de Trujilloes_PE
dc.sourceRepositorio institucional - UNITRUes_PE
dc.subjectDiatraea saccharalises_PE
dc.subjectRAPDSes_PE
dc.subjectCaracterizaciónes_PE
dc.titleCaracterización y variación molecular en Diatraea saccharalis en Saccharum officinarum de las regiones La Libertad y Lima, Perú – 2018es_PE
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/masterThesises_PE
thesis.degree.disciplineMaestría en Ciencias mención Manejo Integrado de Plagas y Enfermedades en Sistemas Agroecológicoses_PE
thesis.degree.grantorUniversidad Nacional de Trujillo.Escuela de Posgradoes_PE
thesis.degree.levelMaestríaes_PE
thesis.degree.nameMaestro en Cienciases_PE
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