Tesis de Segunda Especialidad

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https://hdl.handle.net/20.500.14414/11497

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Browsing Tesis de Segunda Especialidad by Subject "Amplificación de Polimerasa y Recombinasa (RPA)"

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    Diseño de primers del gen meca para detección de Staphylococcus aureus resistente a meticilina por Amplificación de Polimerasa y Recombinasa, Perú 2022.
    (Universidad Nacional de Trujillo, 2023) Chavesta Nuñez, Pedro Jhonatan; Medrano Alhuay, Princesa Alicia; Llanos Román, María Noemí
    El presente trabajo de investigación tuvo como objetivo diseñar primers in silico del gen mecA para la detección de cepas peruanas de S. aureus resistente a la meticilina (SARM) por Amplificación de Polimerasa y Recombinasa (RPA), validando y verificando el cumplimiento de características físico químicas deseables para dichos primers, su especificidad y capacidad de amplificación in silico de tal manera que en el futuro se pueda comprobar su amplificación y capacidad de diagnóstico a nivel de laboratorio. Se obtuvieron 32 secuencias del gen mecA de la base de datos RefSeq del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) procedentes de Perú, consolidando la información en una metadata. Se diseñaron los primers usando los programas bioinformáticos Primer- BLAST y Primer3Plus. Se seleccionaron los dos mejores pares de primers para RPA: el par Nº1 (mecA-RPA-F1 y mecA-RPA-R1) y el par Nº2 (mecA-RPA-F2 y mecA-RPA-R2) al evaluar los parámetros termodinámicos y estructuras secundarias con los programas Oligoanalyzer Tool y Beacon Designer Free Edition. Se verificó la capacidad de amplificar in silico de los primers del gen mecA de S. aureus usando los programas In silico PCR amplificación y PCR Test - Secuences Manipulation Suite (SMS). Se complementó evaluando la especificidad de los primers mediante el software BLAST-N que mostró la capacidad de los primers propuestos para identificar las cepas peruanas de Staphylococcus aureus (con 100% de identidad), las cuales representaron el 62% del total de especies identificadas, mientras que el 38% fueron otras especies de Staphylococcus.