Caracterización del genoma del cloroplasto de Capsicum chinense Jacq. “ají mochero”

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dc.contributor.advisorBlas Cerdan, Willian Genaro
dc.contributor.authorJacobo Sevillano, David Dario
dc.date.accessioned2024-10-09T15:34:08Z
dc.date.available2024-10-09T15:34:08Z
dc.date.issued2024
dc.description.abstractEn este estudio, caracterizamos el genoma del cloroplasto de C. chinense Jacq. "ají mochero" proveniente de La Encalada de El Golf, Trujillo – Perú utilizando la Next Generation Sequencing, Illumina. Los resultados de secuenciación mostraron que el tamaño total del genoma cloroplastidial es de 156, 849 bp, conteniendo una región de copia única larga (LSC por sus siglas en inglés) de 87,330 bp y una región de copia única corta (SSC por sus siglas en inglés) de 17,913 bp, separadas por un par de regiones invertidas repetidas (IRs por sus siglas en inglés) de 25,803 bp. Un total de 133 genes, incluyendo 86 genes que codifican proteínas, 37 genes de tRNA y 8 genes de rRNA. El análisis filogenético reveló que C. chinense "ají mochero" está cercanamente emparentado con una variedad de C. chinense caracterizado por el Instituto Nacional de Ciencias Agrícolas de Corea del Sur y estas dos variedades a la vez se emparentan con el clado de la variedad local peruana “pukunucho”.
dc.description.abstractIn this research we reported and characterized the complete chloroplast genoma sequence of C. chinense Jacq. "ají mochero" from La Encalada of El Golf, Trujillo – Perú, using Next Generation Sequencing, Illumina. The total lenght of the chloroplast genome is 156, 849 bp, containing a large single-copy region (LSC) of 87,330 bp and a small single-copy region (SSC) of 17,913 bp separated by a pair of inverted repeats (IRs) of 25,803. The cp genome harbors 133 known genes, including 86 protein-coding genes, 8 ribosomal RNA genes, and 37 tRNA genes. Phylogenomic analysis revealed that C. chinense "ají mochero" was most closely related to a landrace of C. chinense characterized by the National Institute of Agricultural Sciences of South Korea and these two landraces are related to the clade of the local peruvian ladrace “pukunucho”.
dc.formatapplication/pdf
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.14414/22491
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Nacional de Trujillo
dc.publisher.countryPE
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nd/4.0/
dc.sourceUniversidad Nacional de Trujillo de Trujillo
dc.subjectCapsicum, variedad local, ají mochero, genoma cloroplastidial, filogenia
dc.subject.ocdehttps://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.00
dc.titleCaracterización del genoma del cloroplasto de Capsicum chinense Jacq. “ají mochero”
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesis
dc.type.versioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersion
renati.advisor.dni18006836
renati.advisor.orcidhttps://orcid.org/0000-0001-7581-9297
renati.author.dni73671709
renati.discipline511206
renati.jurorZavala de la Cruz, Fatima
renati.jurorQuijano Jara, Carlos
renati.jurorSaldaña Jimenez, Antonio
renati.levelhttp://purl.org/pe-repo/renati/level#tituloProfesional
renati.typehttp://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis
thesis.degree.disciplineCiencias Biologicas
thesis.degree.grantorUniversidad Nacional de Trujillo. Facultad de Ciencias Biologicas
thesis.degree.nameBiologo
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